Tehokkainta supikoirien poistaminen on pysäyttävän koiran tai luolakoiran avulla. Muita suosittuja pyyntitapoja ovat loukkupyynti ja haaskalta vahtiminen.
Toimivien pyyntimuotojen lisäksi on tärkeää valita sopivat kohteet, joihin pyynti suunnataan. Vieraspetojen pyyntiponnistukset kannattaa kohdistaa vesilintujen pesimäympäristöihin. Ideaalitilanteessa alueella ei ole pesimäaikaan lainkaan vieraspetoja. Jokainen poistettu vieraspeto edesauttaa pesintöjen onnistumista.
Erityisesti kevättalven ja alkukevään (maalis-huhtikuu) aikana tapahtuva vieraslajien poisto on tehokasta kannan hallintaa, koska se kohdistuu lisääntyvään kannanosaan. Keväällä vanhat eläimet ovat varovaisia, joten pelkkä passiivinen pyynti ei tällöin riitä. Jokainen vuoden aikana pyydetty vieraspeto kuitenkin vähentää saalistuspainetta, joten ympärivuotinen pyynti on tarpeen. Supikoiratiheydet ovat varsinkin eteläisessä Suomessa suuria.